- 三島羽田シャトル
東京ディズニーリゾート - 新木場駅 - 羽田空港（羽田エアポートガーデンバスターミナル） - 横浜駅（YCAT） - 三島駅北口 - 三島駅南口 - 三島大場（伊豆箱根バス三島営業所）
【】内は箱根地区の路線バスに導入されている系統記号[11]。『』内はその他の路線に導入されている系統番号[12]。
- 加茂富士見台線
| No.
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運行区間
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| 三33
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加茂中央 → 百合ヶ丘入口 → 三島駅北口（平日 朝片道1本のみ運行）
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| 三61
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三島田町駅 - (菰池) - 三島駅⑥ - 百合ヶ丘入口 - 旭ヶ丘 - 加茂 - (富士見台東) - 富士見台
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| 三62
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三島田町駅 - 三島駅⑥ - (菰池) - 百合ヶ丘入口 - 旭ヶ丘 - 老人福祉センター - 加茂 - (富士見台東) - 富士見台
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| 三63
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三島駅⑥ - (菰池)- 百合ヶ丘入口 - 旭ヶ丘 - 加茂 - (富士見台東) - 富士見台
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| 三64
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三島駅⑥ - (菰池) - 百合ヶ丘入口 - 旭ヶ丘 - 老人福祉センター - 加茂 - (富士見台東) - 富士見台
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| 函12
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函南駅 - 平井 - 岐れ道 - 宝蔵台入口 - 畑毛温泉
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| 三67
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三島駅⑥ - 百合ヶ丘入口 - 旭ヶ丘 - 加茂中央 - きじ公園 - 加茂中央 - 旭ヶ丘 - 百合ヶ丘入口 - 三島駅（きじ公園経由 加茂循環）
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- 【富士見台東は富士見台行きのみ経由する。】
- 【菰池は三島駅方面のみバス停がある。】
- 下土狩線
下記のうち函南町内発着路線はもともと沼津登山東海バス（当時）が運行していたが、運賃収入の低迷と沿線自治体から必要な補助を受けられなかったことを理由に撤退し、一部区間を廃止した上で2008年11月1日より伊豆箱根バスが継承した[4]。大場駅前と熱海駅を結ぶ『熱15』は#熱海駅・湯河原駅発着路線に記載。
- 畑毛温泉線
| No.
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運行区間
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| 大01
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畑毛温泉 → 柿沢台 → 宝蔵台入口 → 岐れ道 → 函南中学校 → 間宮 → 大場駅前 → 岐れ道 → 宝蔵台入口 → 畑毛温泉
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| 大01
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畑毛温泉 → 宝蔵台入口 → 岐れ道 → 函南中学校 → 間宮 → 大場駅前 → 岐れ道 → 宝蔵台入口 → 柿沢台 → 畑毛温泉
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| 大02
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畑毛温泉 → 宝蔵台入口 → 岐れ道 → 函南中学校 → 間宮 → 大場駅前 → 岐れ道 → 宝蔵台入口 → 畑毛温泉
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| 函11
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函南駅 → 平井 → 岐れ道 → 函南中学校 → 間宮 → 大場駅前 → 岐れ道 → 宝蔵台入口 → 畑毛温泉
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| 函11
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畑毛温泉 → 宝蔵台入口 → 岐れ道 → 函南中学校 → 間宮 → 大場駅前 → 岐れ道 → 平井 → 函南駅
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| 函12
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函南駅 - 平井 - 岐れ道 - 宝蔵台入口 - 畑毛温泉
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- [函11]岐れ道 - 函南中学校 - 間宮 - 大場駅前 - 岐れ道間は函南駅行・畑毛温泉行ともに同じ方向に運行する変則ルートになっている。
- 伊豆長岡駅 - シーパラ線
- 伊豆長岡駅 - 長岡温泉場循環線
| No.
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運行区間
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| 長13
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長岡駅 - 温泉駅 - 温泉場西 - 伊豆の国市役所 - 宗徳寺前 - 温泉場中 - 温泉駅 - 長岡駅（長岡温泉場循環）
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- 沼津駅 - 新道・旧道 - 三島駅線
| No.
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運行区間
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| 三05
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沼津駅⑤ - 八幡西 - （旧道） - 三島駅
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| 三07
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沼津駅⑤ - 八幡西 - （新道） - 三島駅(2022年5月1日(日)より休止)
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| 沼06
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沼津駅⑤ → 八幡西 → （バイパス） → 三島田町駅(土休日運行)
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[三07]：東海バスと共同運行。広小路駅以東と八幡西以西は三05と同じ経路で運行する。
2023年7月22日(土)のダイヤ改正にて新道経由は2社とも大幅に減便。東海バスと共同運行。
[三05]：日中30分間隔で、2社が交互に運行する。軌道線（現在は廃線）を元に設定された路線である。
2023年7月22日(土)のダイヤ改正にて旧道経由は30分から1時間間隔となり、さらに沼津駅10時台の便は全便廃止となった。
2024年4月1日(月)のダイヤ改正にて10時台の旧道経由が復活した。(東海バス担当便)
[沼06]：八幡西までは[三05]・[三07]と同じ経路で運行する。
- 沼津駅 - 沼津港循環・御用邸記念公園線
| No.
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運行区間
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| 沼11
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沼津駅① - 上土 - 第二小学校前 - 沼津港 - 魚市場入口 - 御用邸記念公園
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| 沼12 急行
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沼津駅① - 上土 - 沼津港(土休日運行・記載停留所のみ停車)
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| 沼13
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沼津駅① - アーケード名店街 - 第二小学校前 - 第二小学校入口 - 沼津港 - 第二小学校前 - アーケード名店街 - 沼津駅（沼津港循環）
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| 沼14
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沼津駅① - 上土 - 第二小学校入口 - 千本東町 - 千本港町 - 沼津港
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- [沼14]2020年3月より沼津港循環にて小型EVバスが運行を開始した。車両構造と性能の関係でこの系統は静岡県道159号沼津港線を直行する。車両点検時および夏季は通常の車両で運行する。
- 沼津駅 - 沼津港間は全区間200円の均一運賃(沼津駅～沼津駅間も同様に200円)。
- 沼津駅 - 北市内循環（東）線
| No.
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運行区間
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| 沼15
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沼津駅⑥ → 天神ヶ尾 → 五月町 → 沼津駅北口 → 沼津駅（北市内循環・平日1本のみ運行）
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- 沼津駅 - 大岡 - 三島駅線
| No.
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運行区間
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| 沼51
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沼津駅⑥ - 加藤学園前 - 西島病院 - 大岡駅前 - 三島駅
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| 沼52
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沼津駅⑥ - 加藤学園前 - 大岡駅前 - 三島駅
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- 沼津駅 - 大岡循環西・東線
| No.
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運行区間
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| 沼54
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沼津駅⑥ - 加藤学園前 - 西島病院 - 大岡駅前 - 沼津駅（大岡循環）
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| 沼55
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沼津駅⑥ - 加藤学園前 - 大岡駅前 - 沼津駅（大岡循環）
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- 加藤学園前を先に経由する西回りと、大岡駅前を先に経由する東回りがある。
- 沼津駅 - 伊豆長岡駅線
| No.
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運行区間
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| 沼71
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沼津駅③ - 上土 - 市役所前 - 御用邸 - 静浦地区センター前 - 多比 - 長塚 - 宗徳寺前 - 温泉場中 - 温泉駅 - 長岡駅
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| 沼72
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沼津駅③ - 上土 - 市役所前 - 御用邸 - 静浦地区センター前 - 多比 - 長岡リハビリ病院前 - 宗徳寺前 - 温泉場中 - 温泉駅 - 長岡駅
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| 沼73
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沼津駅③ → 上土 → 市役所前 → 御用邸 → 静浦地区センター前 → 多比 → 江間 → 墹の上（ままのうえ） → 長岡駅（平日夕方1便のみ運行）
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| 沼74
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『沼74』沼津駅③ → 上土 → 市役所前 → 御用邸 → 浜通りはまゆう前 → 静浦地区センター → 多比 → 宗徳寺前 → 温泉場中 → 温泉駅 → 長岡駅（平日朝1便のみ運行）
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| 沼76
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『沼76』長岡駅 → 温泉駅 → 温泉場中 → 宗徳寺前 → 多比 → 静浦地区センター前 → 御用邸 → 魚市場入口 → 上土 → 沼津駅（土日祝日午前中1便のみ運行・長塚非経由）
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| 沼77
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沼津駅③ - 上土 - 市役所前 - 御用邸 - 静浦地区センター前 - 多比
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以下の路線では三島・沼津地区ICカード導入前からPASMOが使用可能[1][2]。熱海駅 - 大学病院前間では熱海駅方面行きは仲見世入口を経由し、郊外方面行きは春日町・足川を経由する。
- 【AT】熱海・箱根線
| No.
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運行区間
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| AT51
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熱海駅 - お宮の松 - （起雲閣前） - 来の宮神社前 - 姫の沢公園 - 十国峠登り口 - 富士箱根ランド - 箱根関所跡 - 元箱根 - 箱根園
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| AT52
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熱海駅 - お宮の松 - （起雲閣前） - 来の宮神社前 - （小学校前 - 笹良ヶ台団地上） - 姫の沢公園 - 十国峠登り口 - 富士箱根ランド - 箱根関所跡 - 元箱根
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| AT53
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熱海駅 - お宮の松 - （起雲閣前） - 来の宮神社前 - （小学校前 - 笹良ヶ台団地上） - 姫の沢公園 - 十国峠登り口 - 富士箱根ランド入口 - 箱根関所跡 - 元箱根
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熱海駅 - お宮の松 - （起雲閣前） - 来の宮神社前 - （小学校前 - 笹良ヶ台団地上） - 姫の沢公園 - 十国峠登り口
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- 起雲閣前は元箱根方面のみ、小学校前 - 笹良ヶ台団地上間は【AT51】を除く熱海駅方面のみ経由[1]。
- 十国峠登り口発着便は毎日運行。
AT51箱根園発着便は運行休止中。
- 熱海駅 - 相の原団地線
| No.
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運行区間
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| 熱11
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熱海駅 - お宮の松 - （起雲閣前） - 来の宮駅 - 梅園 - 相の原団地
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- 起雲閣清水町循環線
| No.
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運行区間
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| 熱13
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熱海駅 → お宮の松 → 起雲閣前 → お宮の松 → 熱海駅
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- 梅園・来宮循環
| No.
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運行区間
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| 熱14
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熱海駅 → お宮の松 → 起雲閣前 → 来の宮駅 → 梅園 → 来の宮神社前 → お宮の松 → 熱海駅
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- 熱海大場線
| No.
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運行区間
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| 熱15
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熱海駅 - お宮の松 - （起雲閣前） - 来の宮駅 - 梅園 - 畑 - 平井 - 岐れ道 - 八ッ溝 - 大場駅前
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- 2018年11月1日新設[2]。
- 起雲閣前は大場駅前行きのみ経由。また、大場駅前行きは浄水場前 - 平井間、熱海駅行きは平井 - 伊豆箱根バス車庫前間がそれぞれバス停が設置されておらず無停車[2]。
- 2022年10月1日、平井 - 伊豆箱根バス車庫前間に「畑」バス停を新設[13]。
- 熱海駅 - 笹良ヶ台循環線
| No.
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運行区間
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| 熱21
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熱海駅 → お宮の松 → 起雲閣前 → 来の宮神社前 → 笹良ヶ台団地 → 小学校前 → 来の宮神社前 → お宮の松 → 熱海駅
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| 熱22
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熱海駅 → お宮の松 → 国際専門学校前 → 来の宮神社前 → 笹良ヶ台団地 → 小学校前 → 来の宮神社前 → お宮の松 → 熱海駅
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| 熱23
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熱海駅 → お宮の松 → 国際専門学校前 → 来の宮神社前 → 笹良ヶ台団地 → 小学校前
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| 熱24
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笹良ヶ台団地 → 小学校前 → 来の宮神社前 → お宮の松 → 熱海駅
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- 熱海駅 - 熱海後楽園線
| No.
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運行区間
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| 熱71
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熱海駅 → お宮の松 → 親水公園 → 熱海港 → 熱海後楽園(東海バスと共同運行)
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| 熱71
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熱海後楽園 → 国際専門学校 → お宮の松 → 熱海駅(東海バスと共同運行)
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- 湯河原駅 - 箱根関所跡・元箱根線
| No.
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運行区間
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| 湯01
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湯河原駅 - 不動滝 - （大観山 / 奥湯河原） - 箱根関所跡 - 元箱根
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- 不動滝 - 箱根関所跡間では、元箱根行きは大観山、湯河原駅行きは奥湯河原をそれぞれ経由する[5]。
- 湯河原駅 - 不動滝・奥湯河原線
| No.
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運行区間
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| 湯03
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湯河原駅 - 不動滝 - 奥湯河原
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| 湯05
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湯河原駅 - 不動滝
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- せせらぎ号 - 東海バスと共同で受託[15]
- なかざと号[16]
- 花のまち号 - 伊豆箱根交通と共同受託。朝夕の小型バスで運行する便のみ担当。
- 千代田団地・韮山駅線
- 『韮01』韮山駅 - 改善センター前 - 保健センター前 - 江間 - 千代田団地
- 『韮02』千代田団地 → 江間 → 韮山駅
- 奈古谷温泉口・千代田団地線
- 『韮04』奈古谷温泉口 → 江川邸 → 改善センター前 → 韮山駅 → 改善センター前 → 保健センター前 → 江間 → 千代田団地
- 東海バス・富士急シティバスと共同で受託[17]。南北線の平日第1～3便・土日祝第1・2便と循環線Bを担当。
沼津市内南北循環バス「ビーバス」(2012年4月1日廃止)
- 韮山駅 - 江川邸
- 韮山駅 - 反射炉
- 長岡駅 - 反射炉
- 長岡駅 - 墹の上 - 千代田団地
- 長岡駅 - 長塚 - 千代田団地
- 三島駅 - 上土 - 沼津港
- 三島駅 - 大場駅入口 - 長岡駅口 - 東京電気前 - 修善寺駅
- 修善寺駅 - 上和田橋 - 入屋
- 浜通りはまゆう前 → 静浦地区センター
- 中伊豆線
- 『修24』修善寺駅 - 戸倉野 - 地蔵堂入口 - 貴僧坊 - 筏場（いかだば） - 筏場新田
- 『修25』修善寺駅 - 戸倉野 - 地蔵堂入口 - 地蔵堂 - 筏場
- 姫の湯下→筏場（平日1便のみ運行）
- 筏場→貴僧坊（平日1便のみ運行）
- 地蔵堂入口 - 筏場間はループ状の運転経路になっており、修善寺駅発貴僧坊経由筏場行きは筏場から地蔵堂経由修善寺駅行き（地蔵堂経由筏場行きは筏場から貴僧坊経由修善寺駅行き）となって折り返していた。
- 2022年4月より東海バスを委託先とする伊豆市自主運行バスに転換され、この時筏場 - 筏場新田間が廃止された。
- 大場・函南駅 - 大場・錦が丘分譲地線（2022年4月より三島市自主運行バス花のまち号として運行（運行委託先：伊豆箱根バス、伊豆箱根交通））
- 『大32』あいさつ通り → 錦が丘公園前 → 大場分譲地 → 赤王口 → 大場駅
- 『大36』大場駅 → 赤王口 → 大場分譲地 → あいさつ通り → 錦が丘公園前
- 『大37』大場駅 → 八ッ溝 → 上沢口 → 大場分譲地 → あいさつ通り → 錦が丘公園前 → 大場分譲地 → 赤王口 → 大場駅
- 『大38』大場駅 → 赤王口 → 大場分譲地 → あいさつ通り → 錦が丘公園前 → 大場分譲地 → 上沢口 → 八ッ溝 → 大場駅
- 『大39』大場駅 → 八ッ溝 → 上沢口 → 大場分譲地 → あいさつ通り → 錦が丘公園前 → 大場分譲地 → 上沢口 → 八ッ溝 → 大場駅
- 沼津駅 - 緑ヶ丘循環線
- 『沼16』沼津駅⑥ → 天神ヶ尾 → 緑ヶ丘 → 加藤学園前 → 沼津駅（緑ヶ丘循環）
- 『沼10』沼津駅 - 上土 - 第二小学校前 - 沼津港 - 御用邸 - 多比 - 宗徳寺前 - 温泉場中 - 温泉駅 - 温泉場西 - 伊豆の国市役所 - 伊豆三津シーパラダイス
- 土休日のみ運行だった。2022年9月30日を以て廃止。
- 『長12』伊豆三津シーパラダイス → 伊豆の国市役所 → 温泉場西 → 温泉駅 → 長岡駅
- 『沼78』沼津駅③ - 上土 - 第二小学校入口 - 御用邸 - 静浦地区センター前 - 多比（土日祝日午前中1便のみ運行）
- 『沼79』沼津駅③ - 上土 - 市役所前 - 御用邸 - 静浦地区センター前（平日午後のみ運行）
- 『三07』沼津駅⑤ - 臼井国際産業前 - （新道） - 三島駅(2023年10月31日まで運行)
- 『三05』沼津駅⑤ - 臼井国際産業前 - （旧道） - 三島駅(2023年10月31日まで運行)
- 『沼06』沼津駅⑤ → 臼井国際産業前 → （バイパス） → 三島田町駅(2023年10月31日まで運行)
- 2021年7月3日（土）の黄瀬川大橋の崩落により7月5日（月）の始発便より東海バス沼津営業所柿田線の「東下石田」～「臼井国際産業前」停留所を臨時停留所として設定し運行している。 運賃・定期券・回数券の取り扱いは「久保＝東下石田」、「黄瀬川＝潮音寺」、「黄瀬川橋＝黄瀬川橋南」、「八幡西＝臼井国際産業前」となる。
- 2022年5月1日(日)より迂回運行ルートを本運行とする。(久保〜八幡西停留所間は休止)
- 『沼07』八幡西 → 沼津駅(2022年5月1日(日)より休止)
- 『沼07』臼井国際産業前 → 沼津駅(2022年5月1日(日)新設・2023年7月22日(土)廃止)
- 『修10』修善寺温泉場線 修善寺駅 - 温泉場（修善寺）
- 東海バスと競合[20]。
- 2024年2月1日(木)より全便運休となる。
- 2024年4月1日のダイヤ改正により路線廃止。
- 函南駅線
- 『函21』大場駅 - 八ッ溝 - 上沢口 - 落合 - 函南駅
- 『函22』大場駅 - 赤王口 - 上沢口 - 落合 - 函南駅
- 2024年4月1日のダイヤ改正により路線廃止。函南町による大場・函南デマンドタクシーが代替。函南タクシーに運行委託。平日のみ運行で、事前予約が必要[21]。
- 加茂富士見台線（一部系統）
- 『三65』富士見台 - 加茂 - 加茂入口 - 百合ヶ丘入口 - 三島駅（平日 朝片道1本のみ運行）
- 『三66』三島駅⑥ - 百合ヶ丘入口 - 百合ヶ丘 - 百合ヶ丘入口 - 旭ヶ丘 - 三島駅（百合ヶ丘・旭ヶ丘循環）
- 『学02』相の原団地 → 来の宮神社前 → 来の宮駅
- 三島駅北口 - 伊豆長岡温泉 特急バス
- 三島駅北口 - 百合ヶ丘入口 - 加茂中央 - （伊豆縦貫自動車道） - 伊豆の国市役所 - 古奈温泉南口 - 温泉場中 - 長岡温泉駅[22]
- 2014年5月に開設された路線。三島駅北口 - 加茂中央間は双方向とも乗降可能だったが、江間いちご狩りセンター - 長岡温泉駅間は長岡方面は降車専用、三島方面は乗車専用だった。長距離の運行であることや有料道路を通過することで運行経費が膨らんだものの、それに見合う収入が見込まれないとして、2017年9月1日に廃止された[23]。
- 沼津市ワンコインバス
- 観光周遊型バス「歴バスのる〜ら」
- 函南町役場 - 向原 - 田方農業高校 - 伊豆仁田駅 - 塚本 - 伊豆ゲートウェイ函南
- 2021年11月1日～2024年3月31日実証運行。
- 2023年3月25日～2023年3月31日までは運行休止していた。
- 2023年4月1日に運行経路の変更及びダイヤ改正実施。
- 2024年3月31日をもって運行終了。
当営業所所属の2扉の路線バス用車両は、交通系ICカード対応車両（すなわち熱海駅・湯河原駅発着路線）のみ前乗り・前降りで、それ以外の車両（路線）では後乗り・前降りとなっている[27]。所属車両のナンバープレートは伊豆ナンバーが大多数だが、ごく少数沼津ナンバーの車両が存在する。
