PABPC1(poly(A) binding protein cytoplasmic 1)もしくはPABP1は、ヒトではPABPC1遺伝子にコードされるタンパク質である[5]。PABPC1はmRNAに結合し、内外への輸送、分解、翻訳、安定性などさまざまな機能を促進する。ポリ(A)結合タンパク質には主に核内に位置するもの(PABPN1英語版)と細胞質に位置するもの(PABPC、単にPABPと呼ぶときにはこちらを指すことが多い)が存在し、PABPC1は後者に属する。PABPC1はその位置によって、役割やRNAとの機能が変化する[6]

PABPC1
PDBに登録されている構造
PDBオルソログ検索: RCSB PDBe PDBj
PDBのIDコード一覧

1CVJ, 1G9L, 1JGN, 1JH4, 2K8G, 2RQG, 2RQH, 2X04, 3KTP, 3KTR, 3KUI, 3KUJ, 3KUR, 3KUS, 3KUT, 3PKN, 3PTH, 4F02, 4F25, 4F26, 5DX1, 5DXA, 5DX8, 2D9P

識別子
記号PABPC1, PAB1, PABP, PABP1, PABPC2, PABPL1, poly(A) binding protein cytoplasmic 1
外部IDOMIM: 604679 MGI: 1349722 HomoloGene: 37638 GeneCards: PABPC1
遺伝子の位置 (ヒト)
8番染色体 (ヒト)
染色体8番染色体 (ヒト)[1]
8番染色体 (ヒト)
PABPC1遺伝子の位置
PABPC1遺伝子の位置
バンドデータ無し開始点100,685,816 bp[1]
終点100,722,809 bp[1]
遺伝子の位置 (マウス)
15番染色体 (マウス)
染色体15番染色体 (マウス)[2]
15番染色体 (マウス)
PABPC1遺伝子の位置
PABPC1遺伝子の位置
バンドデータ無し開始点36,595,905 bp[2]
終点36,609,912 bp[2]
遺伝子オントロジー
分子機能 血漿タンパク結合
核酸結合
protein C-terminus binding
translation activator activity
poly(U) RNA binding
poly(A) binding
mRNA 3'-UTR binding
RNA結合
mRNA結合
細胞の構成要素 焦点接着
catalytic step 2 spliceosome
ストレス顆粒
細胞質
cytoplasmic ribonucleoprotein granule
spliceosomal complex

エキソソーム
細胞核
細胞質基質
樹状突起
リボ核タンパク質顆粒
シナプス
messenger ribonucleoprotein complex
リボ核タンパク質
生物学的プロセス ナンセンス変異依存mRNA分解機構
mRNA stabilization
mRNA splicing, via spliceosome
regulation of mRNA stability
RNAスプライシング
mRNA polyadenylation
mRNA processing
nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening
positive regulation of viral genome replication
translational initiation
negative regulation of nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
positive regulation of translation
遺伝子サイレンシング
positive regulation of nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening
positive regulation of nuclear-transcribed mRNA catabolic process, deadenylation-dependent decay
出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
ヒトマウス
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq
(mRNA)

NM_002568

NM_008774

RefSeq
(タンパク質)

NP_002559

NP_032800

場所
(UCSC)
Chr 8: 100.69 – 100.72 MbChr 8: 36.6 – 36.61 Mb
PubMed検索[3][4]
ウィキデータ
閲覧/編集 ヒト閲覧/編集 マウス

機能

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ポリ(A)結合タンパク質(PABまたはPABP)は真核生物のmRNAの3'末端のポリ(A)テールに複合体を形成しており、ポリ(A)鎖の伸長と翻訳の終結に必要なタンパク質である。PABPC1はPABPファミリーの一部を構成している[7]

PABPC1は通常は細胞質内に拡散して存在しており、ストレス顆粒英語版P-body英語版、翻訳活性の高い部位など、mRNAが高濃度で存在する部位に濃縮されている。PABPC1はNMDとも関係している。PABPC1はポリ(A)テールやeIF4G英語版と相互作用し、環状化したmRNAを安定化している。この構造はNMDを介したmRNA分解を防ぐために必要である[8]

PABPC1は核内ではpre-mRNAのポリ(A)テールに結合し、安定性、核外搬出、輸送、分解を促進している。PABPC1は4つのRNA認識モチーフ(RRM)を持つ。最初の2つ(RRM1とRRM2)は、α-インポーチンと、プロセシングされたmRNAの双方に結合する。この結合は、mRNAが核内へ送り返されることを防いでいる[6]

相互作用

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PABPC1は次に挙げる因子と相互作用することが示されている。

出典

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  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000070756 - Ensembl, May 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000022283 - Ensembl, May 2017
  3. ^ Human PubMed Reference:
  4. ^ Mouse PubMed Reference:
  5. ^ “Human mRNA polyadenylate binding protein: evolutionary conservation of a nucleic acid binding motif”. Nucleic Acids Research 15 (12): 4771–87. (June 1987). doi:10.1093/nar/15.12.4771. PMC 305917. PMID 2885805. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC305917/. 
  6. ^ a b “Poly(A)-binding proteins and mRNA localization: who rules the roost?” (英語). Biochemical Society Transactions 43 (6): 1277–84. (December 2015). doi:10.1042/BST20150171. PMID 26614673. 
  7. ^ Entrez Gene: PABPC1 poly(A) binding protein, cytoplasmic 1”. 2023年5月5日閲覧。
  8. ^ “The interaction of cytoplasmic poly(A)-binding protein with eukaryotic initiation factor 4G suppresses nonsense-mediated mRNA decay” (英語). RNA 20 (10): 1579–92. (October 2014). doi:10.1261/rna.044933.114. PMC 4174440. PMID 25147240. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4174440/. 
  9. ^ “The Apc5 subunit of the anaphase-promoting complex/cyclosome interacts with poly(A) binding protein and represses internal ribosome entry site-mediated translation”. Molecular and Cellular Biology 24 (9): 3577–87. (May 2004). doi:10.1128/mcb.24.9.3577-3587.2004. PMC 387753. PMID 15082755. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC387753/. 
  10. ^ “Mechanism of mRNA deadenylation: evidence for a molecular interplay between translation termination factor eRF3 and mRNA deadenylases”. Genes & Development 21 (23): 3135–48. (December 2007). doi:10.1101/gad.1597707. PMC 2081979. PMID 18056425. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2081979/. 
  11. ^ a b “A newly identified N-terminal amino acid sequence of human eIF4G binds poly(A)-binding protein and functions in poly(A)-dependent translation”. The EMBO Journal 17 (24): 7480–9. (December 1998). doi:10.1093/emboj/17.24.7480. PMC 1171091. PMID 9857202. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1171091/. 
  12. ^ “The eukaryotic polypeptide chain releasing factor (eRF3/GSPT) carrying the translation termination signal to the 3'-Poly(A) tail of mRNA. Direct association of erf3/GSPT with polyadenylate-binding protein”. The Journal of Biological Chemistry 274 (24): 16677–80. (June 1999). doi:10.1074/jbc.274.24.16677. PMID 10358005. 
  13. ^ “Paip1 interacts with poly(A) binding protein through two independent binding motifs”. Molecular and Cellular Biology 22 (11): 3769–82. (June 2002). doi:10.1128/mcb.22.11.3769-3782.2002. PMC 133836. PMID 11997512. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC133836/. 
  14. ^ “Interaction of polyadenylate-binding protein with the eIF4G homologue PAIP enhances translation”. Nature 392 (6675): 520–3. (April 1998). Bibcode1998Natur.392..520C. doi:10.1038/33198. PMID 9548260. 
  15. ^ “Dual interactions of the translational repressor Paip2 with poly(A) binding protein”. Molecular and Cellular Biology 21 (15): 5200–13. (August 2001). doi:10.1128/MCB.21.15.5200-5213.2001. PMC 87244. PMID 11438674. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC87244/. 

関連文献

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