BRENDA (化学)
酵素データベース
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BRENDA（The Comprehensive Enzyme Information System、包括的酵素情報システム）は、世界最大級の酵素情報システムである。IUBMBによって分類された酵素の分子および生化学情報が掲載されている。7000を超えるすべての酵素について、「酵素によって触媒される化学反応の反応速度（酵素反応速度論）」の詳細が説明されている。主要な科学文献から手動で抽出した酵素固有のデータからテキストマイニングなどの自動情報検索手法から派生したデータまで様々なデータが含まれる。
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| 内容 | |
| 説明 | molecular and biochemical information on enzymes that have been classified by the IUBMB |
| コンタクト | |
| 研究拠点 | Technische Universität Braunschweig, Department of Biochemistry and Bioinformatics |
| 主要引用 | PMID 21062828 |
| 公開日 | 1987 |
| アクセス | |
| ウェブサイト | http://www.brenda-enzymes.org |
| ダウンロードURL | form |
| WebサービスURL | soap |
| ツール | |
| その他 | |
歴史
編集BRENDAは1987年にブラウンシュヴァイクのドイツバイオテクノロジー研究センター（現在のヘルムホルツ感染研究センター）に設立された。当初は酵素の情報データを掲載する本として出版されていた。BRENDAという名前はブラウンシュヴァイク酵素データベース（Braunschweig Enzyme Database）の頭字語に由来する。1996年から2007年まで、一時的にケルン大学にあり、その期間中にBRENDAは一般にアクセス可能な酵素情報システムに発展した。 2007年にブラウンシュヴァイクに戻り、現在ではブラウンシュヴァイク工科大学のバイオインフォマティクスおよび生化学部門で開発されている。
可用性
編集BRENDAの使用は目的によって無料でなくなることがある。FRENDAとAMENDAは非営利目的のユーザーのみに無料であるが、営利目的のユーザーは、BIOBASEを通じてデータベースのライセンスを得ることが必要となる。
参考文献
編集- “BRENDA, the enzyme information system in 2011”. Nucleic Acids Res 39 (Database issue): D670–76. (2011). doi:10.1093/nar/gkq1089. PMC 3013686. PMID 21062828.
- “BRENDA, AMENDA and FRENDA the enzyme information system: new content and tools in 2009”. Nucleic Acids Res 37 (Database issue): D588–92. (2009). doi:10.1093/nar/gkn820. PMC 2686525. PMID 18984617.
- Springer Handbook of Enzymes (2nd ed.). Heidelberg: Springer. (2006)
- “BRENDA, the enzyme database: updates and major new developments”. Nucleic Acids Res 32 (Database issue): D431–433. (2004). doi:10.1093/nar/gkh081. PMC 308815. PMID 14681450.
- “Review of the BRENDA Database”. Metab Eng 5 (2): 71–73. (2003). doi:10.1016/S1096-7176(03)00008-9. PMID 12850129.
- “BRENDA: a resource for enzyme data and metabolic information]”. Trends Biochem Sci 27 (1): 54–56. (2002). doi:10.1016/S0968-0004(01)02027-8. PMID 11796225.
- “BRENDA, enzyme data and metabolic information”. Nucleic Acids Res 30 (1): 47–49. (2002). doi:10.1093/nar/30.1.47. PMC 99121. PMID 11752250.
- “Enzyme data and metabolic information: BRENDA, a resource for research in biology, biochemistry, and medicine”. Gene Funct Dis 3 (4): 109–118. (2000).