後藤 基国(ごとう もとくに)は、安土桃山時代の武将。通称は新左衛門。
前半生については定かではないが、三木城主の別所長治の家臣であった。天正8年(1580年)に三木合戦における、平田村に於いて羽柴勢と闘い討死。黒田孝高に仕えて黒田二十四騎にも名を連ねる後藤基次(又兵衛)は息子。